Vooroordelen over de hygiëne van de ballenbak blijken te kloppen: ballenbakken zijn een broedplaats voor bacterieën. Kinderen blijken er in te spugen, plassen en te poepen. De Voedsel en Waren Autoreiteit (VWA) trof in 12 van de 40 onderzochte bakken enterobacteriën aan.
Hygiëne afgenomen
Op zich zijn bacterieën volgens de VWA niet per definitie gevaarlijk voor de gezondheid, maar de kans op ziekteverwekkende bacterieën is er veel groter. In 2002 werd er ook al een onderzoek gedaan naar de ballenbak, maar sindsdien is de hygiëne alleen nog maar afgenomen. De VWA adviseert dat de bakken vaker moeten worden gereinigd met desinfecterend middel.